«Я рад остаться в "Баварии". Здесь есть всё для того, чтобы добиваться успеха и при этом чувствовать себя комфортно. Я воспитанник клуба, здесь мои корни, и поэтому особенно приятно осознавать, что моё будущее будет связано с этой командой», — сказал Мюллер.
Мюллер попал в «Баварию» в 11 лет. До этого он играл за команду своего родного города «ТСВ Пель». Поиграв последовательно во всех юниорских и молодёжных составах «Баварии», Мюллер в августе 2008 года дебютировал в бундеслиге.